【激光顯微切割小課堂】組織中的精密空間蛋白質組學信息

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單獨切除細胞培養物中的細胞核，使用已知且未表征蛋白定義的蛋白質組學譜對不同的細胞狀態進行分類。在存檔的原發性黑色素瘤組織中，DVP ^[1] 將空間分辨的蛋白質組變化鑒別為正常的黑色素細胞轉化為wanquan侵襲性黑色素瘤，這揭示了隨著腫瘤進展而以空間方式變化的路徑，如轉移性垂直生長中的mRNA剪接調節異常與干擾素信號和抗原呈遞降低同時進行。DVP在組織背景中保留精密空間蛋白質組學信息的能力對臨床樣本分子表達譜具有一定的意義。

在本研究中，細胞或細胞核使用LMD7激光顯微切割顯微鏡進行切割，該顯微鏡經過調整，適用于自動化的單細胞自動切割^[1]。

References：

1.Automated Laser Microdissection for Proteome Analysis (Deep Visual Proteomics), Flyer, Leica Microsystems, 2022.

2.Rosenberger FA, Thielert M, Strauss MT, Ammar C, M?dler SC, Schweizer L, Metousis A, Skowronek P, Wahle M, Gote-Schniering J, Semenova A, Schiller HB, Rodriguez E, Nordmann TM, Mund A, Mann M: Spatial single-cell mass spectrometry defines zonation of the hepatocyte proteome, bioRxiv, 3. Dec 2022